Ultimate PC Rig for Image Analysis

[Northlander]

Overclockers ASSEEEEEEEEEEEEMBLE.

Χαιρετώ όλους τους hardware geeks της κοινότητας. <img src="/smile.gif" width="" height="" alt="" title="" class="bbcode_smiley" /> Σκοπεύουμε να αγοράσουμε <u>άμεσα</u> (την επόμενη εβδομάδα θα φύγει η παραγγελία δηλαδίς) στο εργαστήριο ένα PC το οποίο θα λειτουργεί αποκλειστικά για ανάλυση εικόνων από πειράματα μικροσκοπίας. Αυτό σημαίνει ότι θα ανοίγουμε datasets μεγέθους έως και 7-8 GB (αποκλειστικά φωτογραφίες/εικόνες) με σκοπό την ανάλυση εικόνας και παραγωγή βίντεο από αυτά. Κύριο πρόγραμμα επεξεργασίας και ανάλυσης θα είναι το Bitplane Imaris, οι απαιτήσεις του οποίου αναγράφονται http://www.bitplane.com/systemrequirements.aspx" class="bbcode_url">εδώ. Το πρόγραμμα χρησιμοποιεί κατά κύριο λόγο την GPU για να κάνει την επεξεργασία του, οπότε θα χρειαστούμε την καλύτερη κάρτα γραφικών. Απαιτούμενα για το στήσιμο του rig είναι τα εξής:

- top-end κάρτα γραφικών με μεγάλη μνήμη, τουλάχιστον 6 GΒ (GTX Titan or R9 290?)
- 64 GB RAM
- 2 SSD, ένας για το λειτουργικό σύστημα και ένας που θα χρησιμοποιείται αποκλειστικά για τη cache του προγράμματος
- 1 extra σκληρός για αποθήκευση μεγάλης χωρητικότητας, στη συνέχεια θα παραγγελθεί RAID setup
- Μη διστάσουμε να βάλουμε και έναν i7 ή τον αντίστοιχο της AMD (αν έχει ίδια απόδοση)
- Τρομερά σημαντικό: οθόνη που έχει τις καλύτερες προδιαγραφές για ανάλυση εικόνας με εκπληκτικό contrast, καλό κόκκο και αρκετές ίντσες (σκέφτομαι κοντά στις 27" αλλά ίσως πάμε και λίγο πιο πολύ). Ναι, θα είναι Dell (καλά και ΕΙΖΟ να είναι δε μας χαλάει)

Το overclocking potential δεν είναι κάτι που ψάχνουμε, αρκεί ο υπολογιστής να αντέξει όπως είναι από τη μαμά του για τουλάχιστον την επόμενη 6-7ετία (εφικτόν πιστεύω).

Budget limit: ΔΕΝ υπάρχει! Το μυστικό είναι να φτιαχτεί ένα σύστημα το οποίο θα έχει το μέγιστο optimization μεταξύ των κομματιών του hardware (από τις διάφορες iterations της εκάστοτε εταιρείας). Το κόστος μπορεί να δικαιολογηθεί. Φυσικά κίνηση που θα κοστίζει £300 λίρες περισσότερο για να δώσει 0.01% καλύτερη απόδοση δεν είναι επιθυμητή. Επομένως go crazy, αλλά με ρεαλισμό κοιτώντας το βέλτιστο πλατώ από άποψη performance/price.

Ως πλατφόρμα για τη διαθεσιμότητα των κομματιών, αν μπορείτε χρησιμοποιείστε το http://overclockers.co.uk/" class="bbcode_url">overclockers.co.uk μιας και είναι συμβεβλημένος προμηθευτής με το πανεπιστήμιο του Manchester.

PS: Sorry Φραπέ, δεν ήθελα να σου κλέψω τον κεραυνό του Frappenstein. Σκέψου ότι θα έχω αυτό το μωρό και δε θα μπορέσω να βάλω Witcher 3. <img src="/frown.gif" width="" height="" alt="" title="" class="bbcode_smiley" />

 

[vtheofilis]

Στα κομμάτια, όλοι αναβαθμίζονται, το μανάρι μου μόνο παιδεύεται :throw:
Το πρόγραμμα υποστηρίζει OpenCL ή CUDA; Για το πρώτο θες AMD κάρτες, για το 2ο nVidia.
Επειδή θα είναι μνημοβόρο, αναγκαστικά θα πάτε σε X79.
Περισσότερα οσονούπω.

 

[Northlander]

vtheofilis wrote:
Το πρόγραμμα υποστηρίζει OpenCL ή CUDA; </blockquote>

You got me there.

 

[vtheofilis]

Εμ, που πας ξεβράκωτος στα αγγούρια; <img src="/tongue.gif" width="" height="" alt="" title="" class="bbcode_smiley" />
Επίσης ρώτα αν επωφελείται από επαγγελματικές GPU και CPU. Στάμπαρα μια ASUS WorkStation μητρική μούρλια. :woohoo:

 

[Northlander]

Θα επικοινωνήσω με το support team τους σε κάποια στιγμή μόλις αρχίσουν να έρχονται ιδέες.

 

[nortrom]

<blockquote>Επίσης ρώτα αν επωφελείται από επαγγελματικές GPU και CPU. Στάμπαρα μια ASUS WorkStation μητρική μούρλια</blockquote>

HW geek δεν είμαι αλλά έχω την εντύπωση πως για αυτή τη δουλειά είναι καλύτερες οι επαγγεματικές κάρτες τύπου Quadro.

 

[Northlander]

Κατά πόσο όμως υπάρχει καλύτερη ανάλυση εικόνας από τις Quadro από ότι αν έπαιρνα μία συμβατική top gaming GPU όπως η R9?

 

[ccwr]

κι έγω άφηνα την φαντασία μοθ να οργιάσει για multi gpu με τίποτα quadro, αλλά μετά διάβασα αυτό, στο λινκ με τις απαιτήσεις του λογισμικού<blockquote>The professional boards are recommended only when stereo displays will be attached. Otherwise the game boards are the better choice because of their extremely better price performance ratio.</blockquote>

Άρα υποθέτω καλύτερα Titan ή 290χ...

Αν καταλαβαίνω καλά, θες ένα τερατάκι με μέχρι 8πυρινο cpu (το λογισμικό δεν υποστηρίζει 2 cpu, σωστά; ), 64 gb RAM και ένα τέρας κάρτα γραφικών ε; θα βάλετε πολλές οθόνες; [strike]Αν σκοπεύεται να έχετε stereo dispalys έχει νόημα και το sli/crossfire[/strike]

 

[Northlander]

Καλά που μου το θύμισες!!!

Το πρόγραμμα έχει πρόβλημα με το mulitdisplay!!!!! Έχει σοβαρά bugs με δύο οθόνες, για αυτό και πρότεινα μία μεγάλη οθόνη για δουλειά. Πρέπει να στείλω email και για αυτό για να επιβεβαιώσω ότι στην τελευταία έκδοση τα πράγματα είναι οκ, διαφορετικά μία οθόνη είναι αυτή που θα κάνει τη δουλειά. Δεν ξέρω αν υποστηρίζει 2 cpu, πάντως ένας 8-πύρηνος κάνει τη δουλειά του μια χαρά (δουλεύει και με 2πύρηνο, αλλά γιατί να πάρουμε 2 όταν μπορούμε με 8? <img src="/tongue.gif" width="" height="" alt="" title="" class="bbcode_smiley" />).

Edit: Ο 8πύρηνος είναι απαιτούμενο, μιας και στο πακέτο που έχει αγοραστεί περιλαμβάνεται το Imaris Batch που πρακτικά είναι high-throughput analysis που τρέχει αλγόριθμους σε πολλαπλά datasets.

 

[manos426f]

Yπάρχει και η λύση της AMD FirePro W9100.... <img src="/tongue.gif" width="" height="" alt="" title="" class="bbcode_smiley" />

***edit***

Ε, χωρίς multidisplay δεν έχει και πολύ νόημα

 

[Northlander]

manos426f wrote:
Yπάρχει και η λύση της AMD FirePro W9100.... <img src="/tongue.gif" width="" height="" alt="" title="" class="bbcode_smiley" /></blockquote>

Intredasting, αλλά way overpriced. Με τόσα λεφτά αγοράζουμε όλο το σύστημα και τρέχει νεράκι.

 

[ccwr]

Μια ιδέα στα γρήγορα γιατί πρέπει να πάω παραλία :cheer:

CPU: http://www.overclockers.co.uk/showproduct.php?prodid=CP-521-IN&groupid=701&catid=6&subcat=1823
Mobo: http://www.overclockers.co.uk/showproduct.php?prodid=MB-489-AS&groupid=701&catid=5&subcat=2174
RAM: http://www.overclockers.co.uk/showproduct.php?prodid=MY-386-CS&groupid=701&catid=8&subcat=817
GPU: http://www.overclockers.co.uk/showproduct.php?prodid=GX-137-GI&groupid=701&catid=1914&subcat=1576
PCIe SSD: http://www.overclockers.co.uk/showproduct.php?prodid=HD-085-OC
HDD: http://www.overclockers.co.uk/showproduct.php?prodid=HD-413-WD&groupid=1657&catid=1660&subcat=1954 (2 ή 4 ανάλογα τα κέφια και τις ανάγκες backup)
PSU: http://www.overclockers.co.uk/showproduct.php?prodid=CA-001-EA&groupid=701&catid=123&subcat=2463

3100 λίρες με 3300 ανάλογα πόσους δίσκους θα βάλεις

Μας λέιπει οθόνη και κουτί. Θα επανέλθω και για διορθώσεις. Τυχόν μπινελίκια για κάποια βιαστική επιλογή είναι απολύτως δεκτά :lol: :lol:

 

[vtheofilis]

Υπάρχουν και πιο φτηνές Quadro, και πιο φτηνές FirePro.
Οι επαγγελματικές GPU υπερέχουν σε ποιότητα υλικού και λογισμικού, ποσότητα και είδος (ECC) RAM. Αλλά όταν πχ το αντίστοιχο σε FirePro της 7770 έχει κοντά στα 400€, πρέπει να αξιολογήσεις πολύ προσεκτικά κατά πόσο χρειάζεσαι αυτά τα χαρακτηριστικά. Πχ το ότι οι απλές μνήμες δεν έχουν ECC, δεν πάει να πει ότι κρασάρουν συνεχώς.

 

[Northlander]

Προσωπικά έχω τρέξει το πρόγραμμα σπασμένο στο laptop/PC μου ([email protected] GHz με 8 GB RAM και την 560M). Δεν είχα συναντήσει κάποιο πρόβλημα στην ανάλυση μικρού όγκου datasets (1-2GB) παρότι το φόρτωμα στην 3D ανάλυση έπαιρνε 10-15 δευτερόλεπτα για κάθε εικόνα.

Προφανώς μιλάμε όμως για δουλειά που έχει ως στόχο το καλύτερο δυνατό με τη μέγιστη απόδοση σε χρόνο, μιας και αυτά με τον καιρό (και το καλό) θα πάνε για δημοσιεύσεις κτλ από ομάδα 30+ ατόμων.

Διαφορά των XEON από τους τυπικούς i7/i5?

Ευκαιρία να μάθω και 2-3 πράγματα στα οποία είχα μείνει απίστευτα πίσω (gfx evolution). Ευχαριστώ όλους για τη βοήθεια, keep 'em coming!

 

[vtheofilis]

Κυριότερες;
Υποστήριξη πολλαπλών CPU και μνήμης ECC.
Πιο σφικτός ποιοτικός έλεγχος. Για κάτι στο οποίο θα χαθούν ζωές αν κρασάρει, θα βάλεις Xeon. H Intel δεν δίνει εγγύηση για τέτοιου είδους δουλειές στους απλούς επεξεργαστές.

 

[Northlander]

Με βλέπω να φτιάχνω μυστικά accounts από το ΙΤ department και να ρίχνω ξενύχτια στο Witcher 3.... εεε, εννοώ σε imaging analysis.

Οπότε πάμε για XEON. Γενικώς με προβληματίζει το γεγονός ότι στη σελίδα των reqs η Bitplane αναφέρεται σε slow triangle rendering με τις τελευταίες κάρτες της Nvidia. Πρέπει να δω τι σκατά σημαίνει αυτό, διαφορετικά μάλλον πάμε για ΑΤΙ μεριά.

 

[infamousjohn]

North, ασε τα σαπια και παραδεξου οτι ο επιστημονικος υπευθυνος ζητησε μηχανημα που να σηκωνει το watch dogs σε 4Κ αναλυση χωρις framedrop κατω απο τα 100fps...

 

[Northlander]

Δε νομίζω ότι μπορεί να υπάρχει τέτοιο rig.

 

[nortrom]

Northlander wrote:
Δε νομίζω ότι μπορεί να υπάρχει τέτοιο rig. </blockquote>

Έχεις μείνει πίσω

http://www.enet.gr/?i=news-room.el&id=438681

 

[vtheofilis]

Σχετικά με τους XEON, Βόρειε, ίσως είναι υπερβολή.
Τα λάθη που διορθώνει το ECC προκαλούνται κυρίως από την κοσμική ακτινοβολία και την φυσική ραδιενέργεια. Ψάξ' το αυγό και κούρεψε το. Εσένα σε ενδιαφέρει να μην επηρεάζεται η 3d μοντελοποίηση των δειγμάτων που θα αναλύεις, σωστά;