O αναπάντεχος θάνατος του έμπειρου Hank Chinnaski στην προηγούμενη αποστολή συγκλόνισε τους πάντες στην XCOM, όμως the show must go on. Ο Tony Corvus συνεχίζει να βρίσκεται κλεισμένος στο σκοτεινό και κάπως creepy Psi Lab, ενισχύοντας τις ικανότητές του. Μάλιστα είναι έτοιμος να αποκτήσει το υπέρτατο όπλο του mind domination:
O οποιοσδήποτε εφησυχασμός απαγορεύεται καθώς ο δείκτης του Avatar Project παραμένει σε εξαιρετικά υψηλά επίπεδα. Προσπαθούμε με γρήγορες κινήσεις να αποκτήσουμε πρόσβαση σε περιοχές που βρίσκονται βάσεις των εξωγήινων ώστε να έχουμε την επιλογή της καταστροφής τους για την μείωση του δείκτη.
Ευτυχώς η αποστολή covert action που είχαν αναλάβει οι soad667 και Dim Gian Bot στέφθηκε με επιτυχία και ο δείκτης υποχωρεί. Δυστυχώς όμως η επιτυχία είχε ως τίμημα τον τραυματισμό του ηγέτη της ομάδας μας.
Ταυτόχρονα δεν πρέπει να ξεχνάμε και τους βασικούς στόχους της campaign. Έτσι, επισπεύδεται η κατασκευή του Shadow Chamber με στόχο την προώθηση της έρευνας των σχεδίων των εξωγήινων.